تغییرات ساختاری ژن مقاومت به زنگ قهوه ای lr۳۵ در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان (triticum aestivum l.)
نویسندگان
چکیده
زنگ قهوه ای از بیماری های مهم گندم است که باعث کاهش عملکرد آن می شود. تولید ارقام مقاوم یکی از راهکارهای اصلی کنترل بیماری زنگ گندم است. لازمه این عمل، شناخت ژنتیک مقاومت و ژن های مقاومت به بیماری است. در این مطالعه با استفاده از سه جفت آغازگر اختصاصی طراحی شده براساس داده های موجود در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (ncbi)، قطعاتی بطول 351-340 جفت باز از ژن lr35 تکثیر شد. قطعات پس از همسانه سازی، توالی یابی شدند. بلاست توالی قطعات تکثیری از ژن lr35 در ژنوتیپ های مورد مطالعه، شباهت 95 درصد با توالی ژن lr35 گندم نان از ncbi نشان داد. علاوه بر این، توالی های حاصل دارای شباهت 93 درصد با ژن lr21 از کلون کاسمیدی 1–7–69 aegilops tauschii، 87 درصد با ژن گلوتنین a با وزن مولکولی بالا از triticum turgidum، 84 درصد با ژن پلاستیدی استیل کوآنزیم آ کربوکسیلاز (acc–1) ازt. turgidum و ژن های مقاومت به سفیدک پودری و تحمل به سرمای گندم نان بود. توالی های تکثیری با استفاده از سه جفت آغازگر، دارای یک چارچوب قرائت آزاد، به ترتیب به طول 162، 156 و 160 جفت باز بوده و پروتئین هایی بطول 54، 52 و 54 اسیدآمینه رمز کردند. بررسی ساختار توالی-ها نشان دهنده وجود ناحیه غنی از لوسین، از نواحی حفاظت شده در ژن های مقاومت به بیماری ها در گیاهان بود. تجزیه خوشه ای براساس توالی قطعات تکثیری از ژن lr35 با استفاده از جفت آغازگر دوم ژنوتیپ ها را براساس پاسخ به زنگ آن ها گروه بندی کرد. نسبت جایگزینی های نامشابه به مشابه نشان دهنده نقش احتمالی گزینش مثبت و یا گرینش ایجاد کننده تنوع در تغییرات نوکلئوتیدی این ژن بود. با توجه به وجود تفاوت های نوکلئوتیدی بین ژنوتیپ های مقاوم، نیمه مقاوم و حساس، می توان از آن ها برای طراحی آغازگرهای اختصاصی مبتنی بر snpها جهت شناسایی ارقام حساس و مقاومت به زنگ قهوه ای در گندم استفاده کرد.
منابع مشابه
تغییرات ساختاری ژن مقاومت به زنگ قهوه‌ای Lr35 در ژنوتیپ های مقاوم و حساس گندم نان (Triticum aestivum L.)
زنگ قهوه‌ای از بیماری‌های مهم گندم است که باعث کاهش عملکرد آن می‌شود. تولید ارقام مقاوم یکی از راهکارهای اصلی کنترل بیماری زنگ گندم است. لازمه این عمل، شناخت ژنتیک مقاومت و ژن‌های مقاومت به بیماری است. در این مطالعه با استفاده از سه جفت آغازگر اختصاصی طراحی شده براساس داده‌های موجود در مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI)، قطعاتی بطول 351-340 جفت باز از ژن Lr35 تکثیر شد. قطعات پس از همسانه‌سازی...
متن کاملتغییرات ساختاری ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای (leaf rust) در ارقام مقاوم و حساس گندم نان
چکیده ندارد.
15 صفحه اولتنوع نوکلئوتیدی نواحی ژنومی ژن های مقاومت به زنگ قهوه ای Lr29 و Lr47 در لاین های گندم نان (Triticum aestivum L.)
متن کامل
شناسایی ژنوتیپ‌های متحمل به تنش خشکی در ژنوتیپ های گندم نان (.Triticum aestivum L)
به‌منظور شناسایی ژنوتیپ‌های گندم متحمل به تنش خشکی در گلخانه و مزرعه، 30 ژنوتیپ به‌عنوان فاکتور فرعی به‌صورت کرت‌های خردشده در قالب طرح کاملاً تصادفی و بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار در شرایط بدون تنش (آبیاری به‌صورت متداول تا آخر فرایند رشد گیاه صورت گرفت) و تنش خشکی مرحله گلدهی (آبیاری تا مرحله گلدهی به‌صورت متداول و طبیعی انجام گرفت و تنش خشکی بعدازآن مرحله اعمال گردید) در سال 96-1395 در گل...
متن کاملبررسی واکنش ژنوتیپ های گندم نان (Triticum aestivum L.) به تنش شوری
بررسی واکنش ژنوتیپ های گندم نان (Triticum aestivum L.) به تنش شوری مسعود گماریان1*، محمد علی ملبوبی2، فرخ درویش3، سید ابوالقاسم محمدی4، خدیجه رضوی2 1- عضو هیات علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد اراک 2- عضو هیات علمی پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری 3- استاد گروه زراعت واصلاح نباتات، دانشگاه آزاد اسلامی واحد علوم و تحقیقات تهران 4- دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه تبریز تاریخ...
متن کاملارزیابی مقاومت به زنگ قهوه ای در مرحله گیاه بالغ در تعدادی از ارقام گندم نان
سابقه و هدف: از جمله بیماری‌های قارچی مهم گندم در سراسر جهان سه زنگ سیاه ، زرد و قهوه‌ای هستند که باعث کاهش شدید عملکرد آن می‌شوند. زنگ قهوه‌ای با عاملPuccinia triticina Eriks. یکی از مخرب‌ترین بیماری‌های گندم درسطح جهان از جمله ایران می‌باشد، که علاوه بر کاهش عملکرد دانه، باعث افت کیفی آن نیز می‌گردد. هدف از این پژوهش ارزیابی تعدادی از ارقام گندم نان براساس صفات و شاخص‌های مقاومت به زنگ قهوه‌ا...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
علوم زراعی ایرانجلد ۱۲، شماره ۴، صفحات ۴۹۹-۵۰۹
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023